Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●D-I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●D-QUARK ●DRfold ●DRfold2 ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred ●TCRfinder

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●DeepMSA2 ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP Library
>protein
GVGSVAALLTVVFYIAAVMATNLYGATFPEWFGDLSKSLYTLFQVMTLESWSMGIVRPVMNVHPNAWVFFIPFIMLTTFT
VLNLFIGIIVD

The query sequence (length=91) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6sxc:A 271 91 0.9890 0.3321 0.9890 8.04e-61 5bzb:B, 5bzb:C, 5bzb:D, 4cbc:A, 4cbc:B, 4cbc:C, 4cbc:D, 4oxs:A, 4oxs:B, 4oxs:C, 4oxs:D, 4p2z:B, 4p30:A, 4p30:B, 4p30:C, 4p30:D, 4p9o:A, 4p9o:B, 4p9o:C, 4p9o:D, 4p9p:B, 4p9p:D, 4pa3:A, 4pa3:B, 4pa3:C, 4pa3:D, 4pa4:A, 4pa4:B, 4pa4:C, 4pa4:D, 4pa6:A, 4pa6:B, 4pa6:C, 4pa6:D, 4pa7:A, 4pa7:B, 4pa7:C, 4pa7:D, 4pa9:A, 4pa9:B, 4pa9:C, 4pa9:D, 8s6j:A, 6sx5:A, 6sx7:A, 6sxe:A, 6sxf:A, 6sxf:B, 6sxg:A, 4x88:A, 4x88:B, 4x88:C, 4x88:D, 4x89:B, 4x8a:B, 4x8a:C, 4x8a:D, 6yz0:A, 6yz2:A, 6z8c:A, 3zjz:A, 3zjz:B, 3zjz:C, 3zjz:D
2 7pgg:A 147 91 0.6484 0.4014 0.6484 4.09e-40 7pgg:B, 7pgi:E
3 5ek0:A 250 91 0.6813 0.2480 0.6813 1.95e-39 5ek0:B, 5ek0:C, 5ek0:D
4 6n4i:C 226 91 0.6703 0.2699 0.6703 5.03e-39 6n4i:A, 6n4i:D, 6n4i:B
5 5hk7:A 139 91 0.6154 0.4029 0.6154 1.66e-38 5hk7:B, 5hk7:C, 7pgb:c, 7pgb:Z, 7pgb:d, 7pgb:o, 7pgb:l, 7pgb:h, 7pgb:e
6 5klb:A 267 91 0.6484 0.2210 0.6484 6.24e-37 6c1e:A, 6c1e:B, 6c1k:A, 6c1k:B, 6c1m:A, 6c1m:B, 8h9w:A, 6juh:C, 6ke5:A, 6ke5:B, 6ke5:C, 6ke5:D, 6keb:C, 6keb:D, 5klb:B, 5klb:C, 5klb:D, 5klg:D, 5klg:C, 5kls:C, 5kmf:A, 5kmh:A
7 4dxw:A 210 87 0.4176 0.1810 0.4368 7.96e-16
8 8j7m:A 257 100 0.3187 0.1128 0.2900 7.63e-10 8j7m:C, 8j7m:D, 8j7m:B
9 8j7h:B 290 67 0.2527 0.0793 0.3433 1.07e-08 8j7f:A, 8j7f:B, 8j7f:C, 8j7f:D, 8j7h:C, 8j7h:D, 7x5v:A, 7x5v:B, 7x5v:C
10 7eeb:A 258 95 0.3297 0.1163 0.3158 4.29e-06
11 6kzo:A 967 70 0.2308 0.0217 0.3000 3.79e-05
12 6kzo:A 967 95 0.2527 0.0238 0.2421 0.002
13 6kzo:A 967 59 0.2088 0.0196 0.3220 0.84
14 6kzo:A 967 62 0.1538 0.0145 0.2258 3.7
15 6kzp:A 1014 70 0.2308 0.0207 0.3000 3.95e-05
16 6kzp:A 1014 96 0.2527 0.0227 0.2396 0.002
17 6kzp:A 1014 59 0.2088 0.0187 0.3220 0.81
18 6kzp:A 1014 62 0.1538 0.0138 0.2258 3.8
19 9ayh:A 1056 70 0.2308 0.0199 0.3000 7.54e-05 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
20 9ayh:A 1056 94 0.2418 0.0208 0.2340 0.001 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
21 9ayh:A 1056 59 0.2088 0.0180 0.3220 0.53 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
22 7wli:A 1135 86 0.2637 0.0211 0.2791 2.37e-04 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
23 7wli:A 1135 103 0.2418 0.0194 0.2136 0.004 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
24 7wli:A 1135 59 0.2088 0.0167 0.3220 0.86 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
25 8e59:A 1230 113 0.3187 0.0236 0.2566 5.62e-04 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
26 8e59:A 1230 67 0.2088 0.0154 0.2836 0.015 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
27 8e59:A 1230 66 0.1978 0.0146 0.2727 0.27 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
28 6jp5:A 1274 113 0.3077 0.0220 0.2478 0.001 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
29 6jp5:A 1274 60 0.1978 0.0141 0.3000 0.010 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
30 6jp5:A 1274 66 0.1868 0.0133 0.2576 0.45 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
31 7jpx:A 1116 113 0.3077 0.0251 0.2478 0.002 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
32 7jpx:A 1116 60 0.1978 0.0161 0.3000 0.009 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
33 7jpx:A 1116 66 0.1868 0.0152 0.2576 0.38 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
34 8wea:A 1206 107 0.3077 0.0232 0.2617 0.002
35 8wea:A 1206 59 0.1868 0.0141 0.2881 0.099
36 8wea:A 1206 66 0.1978 0.0149 0.2727 0.18
37 7mix:A 1326 60 0.2088 0.0143 0.3167 0.002 7miy:A
38 7mix:A 1326 108 0.2857 0.0196 0.2407 0.015 7miy:A
39 7mix:A 1326 69 0.2198 0.0151 0.2899 6.9 7miy:A
40 7vfs:A 1266 60 0.2088 0.0150 0.3167 0.002 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
41 7vfs:A 1266 108 0.2857 0.0205 0.2407 0.012 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
42 7vfs:A 1266 69 0.2198 0.0158 0.2899 7.3 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
43 8fhs:A 1282 111 0.3077 0.0218 0.2523 0.007 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
44 8fhs:A 1282 59 0.1868 0.0133 0.2881 0.092 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
45 8fhs:A 1282 66 0.1978 0.0140 0.2727 0.18 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
46 8x90:A 1377 51 0.1868 0.0123 0.3333 0.007 8x91:A, 8x93:A
47 8x90:A 1377 87 0.2967 0.0196 0.3103 0.018 8x91:A, 8x93:A
48 8x90:A 1377 26 0.1319 0.0087 0.4615 0.083 8x91:A, 8x93:A
49 7xm9:A 1230 70 0.2198 0.0163 0.2857 0.007 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
50 7xm9:A 1230 84 0.2418 0.0179 0.2619 0.096 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
51 8epm:A 991 59 0.1978 0.0182 0.3051 0.009
52 8epm:A 991 119 0.3187 0.0293 0.2437 0.018
53 8epm:A 991 87 0.2527 0.0232 0.2644 0.024
54 7w9l:A 1420 61 0.2088 0.0134 0.3115 0.009 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
55 7w9l:A 1420 84 0.2418 0.0155 0.2619 0.092 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
56 7xlq:A 1319 50 0.1868 0.0129 0.3400 0.010 8epl:A, 7yg5:A
57 7xlq:A 1319 119 0.3187 0.0220 0.2437 0.020 8epl:A, 7yg5:A
58 7xlq:A 1319 87 0.2527 0.0174 0.2644 0.032 8epl:A, 7yg5:A
59 8fhd:A 1294 70 0.2198 0.0155 0.2857 0.013
60 8fhd:A 1294 83 0.2308 0.0162 0.2530 0.23
61 8gz2:B 1174 70 0.2198 0.0170 0.2857 0.013 8gz1:B
62 8gz2:B 1174 81 0.2088 0.0162 0.2346 0.28 8gz1:B
63 6agf:A 1138 62 0.2308 0.0185 0.3387 0.014
64 6agf:A 1138 84 0.2308 0.0185 0.2500 2.8
65 8eoi:K 1116 115 0.3187 0.0260 0.2522 0.028
66 8eoi:K 1116 59 0.1868 0.0152 0.2881 0.082
67 8eoi:K 1116 66 0.1978 0.0161 0.2727 0.17
68 7xsu:A 1085 71 0.2308 0.0194 0.2958 0.052
69 7xsu:A 1085 81 0.2198 0.0184 0.2469 0.68
70 6xiw:A 1256 67 0.1758 0.0127 0.2388 0.052
71 6xiw:A 1256 62 0.1648 0.0119 0.2419 0.98
72 6xiw:A 1256 61 0.1868 0.0135 0.2787 3.7
73 6xiw:A 1256 110 0.2967 0.0215 0.2455 5.6
74 6uz3:A 1126 71 0.2308 0.0187 0.2958 0.053 7fbs:A
75 6uz3:A 1126 81 0.2198 0.0178 0.2469 0.67 7fbs:A
76 8f6p:A 1091 71 0.2308 0.0192 0.2958 0.053
77 8f6p:A 1091 81 0.2198 0.0183 0.2469 0.68
78 7sx3:A 1386 67 0.1758 0.0115 0.2388 0.058 7sx4:A
79 7sx3:A 1386 62 0.1648 0.0108 0.2419 1.1 7sx4:A
80 7sx3:A 1386 61 0.1868 0.0123 0.2787 4.5 7sx4:A
81 7sx3:A 1386 110 0.2967 0.0195 0.2455 6.0 7sx4:A
82 7cu3:A 1277 67 0.1758 0.0125 0.2388 0.059
83 7cu3:A 1277 62 0.1648 0.0117 0.2419 1.2
84 7cu3:A 1277 61 0.1868 0.0133 0.2787 4.3
85 7cu3:A 1277 110 0.2967 0.0211 0.2455 6.5
86 8t6l:A 1237 71 0.2308 0.0170 0.2958 0.061 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
87 8t6l:A 1237 81 0.2198 0.0162 0.2469 0.73 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
88 6j8e:A 1139 71 0.2308 0.0184 0.2958 0.065 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
89 6j8e:A 1139 84 0.2418 0.0193 0.2619 0.26 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
90 8xmn:A 1277 70 0.2088 0.0149 0.2714 0.079 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
91 8xmn:A 1277 84 0.2418 0.0172 0.2619 0.092 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
92 7we4:A 1122 72 0.2527 0.0205 0.3194 0.12 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
93 7we4:A 1122 58 0.1538 0.0125 0.2414 5.0 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
94 7roq:A 1831 41 0.1978 0.0098 0.4390 0.38
95 8f0p:A 1116 73 0.2088 0.0170 0.2603 0.41 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
96 6a91:A 1323 73 0.2088 0.0144 0.2603 0.47 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
97 6c9a:B 723 61 0.1648 0.0207 0.2459 0.75 6c9a:A
98 3gyy:D 311 23 0.1319 0.0386 0.5217 1.4 3gyy:A, 3gyy:B, 3gyy:C, 2vpn:A, 2vpn:B, 2vpo:A, 2vpo:B
99 8ee6:A 1808 38 0.1538 0.0077 0.3684 1.6 8edw:A
100 8eop:A 1687 38 0.1538 0.0083 0.3684 1.6
101 8ouo:A 648 103 0.2418 0.0340 0.2136 1.9
102 8ouo:B 625 103 0.2418 0.0352 0.2136 2.0 6nq0:A, 6nq0:B, 6nq2:A, 6nq2:B
103 7tj9:A 1111 70 0.1978 0.0162 0.2571 2.6
104 1cf3:A 581 31 0.1429 0.0224 0.4194 4.3 1gal:A, 8jpz:A, 8jpz:B, 5nit:A, 5niw:A, 3qvp:A, 3qvr:A
105 7tbw:A 1928 38 0.1758 0.0083 0.4211 5.7
106 6pw4:B 675 24 0.0989 0.0133 0.3750 5.9 6pw4:D
107 4xzw:A 305 37 0.1319 0.0393 0.3243 6.0
108 7tby:A 1788 38 0.1758 0.0089 0.4211 6.1 7tc0:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417